Proteus spp. играют важную роль в этиологии и патогенезе хронических инфекций мочевых путей - отчасти потому, что образуют уреазу, расщепляющую мочевину до гидроксида аммония, и тем самым способствуют ощелачиванию мочи и образованию трипельфосфатных камней. Эти камни препятствуют оттоку мочи, служат постоянным очагом инфекции и способствуют разрушению почечной паренхимы.

Proteus spp. - частые возбудители инфекций у ослабленных больных, получающих антибиотики широкого спектра действия . Подобно другим грамотрицательным бактериям , они часто обсеменяют ожоговые раны , пролежни и операционные раны . Proteus spp. нередко обнаруживают при хроническом среднем отите и мастоидите : эти инфекции могут осложниться тугоухостью , тромбозом поперечного синуса , менингитом или абсцессом головного мозга и закончиться смертью. При повреждениях глаза Proteus spp. вызывают язву роговицы с последующим развитием панофтальмита . Как и другие грамотрицательные бактерии, Proteus spp. вызывают сепсис и септический шок . Воротами инфекции в большинстве случаев бывают мочевые пути, реже - желчные пути, ЖКТ, другие органы. Поэтому тут важно вовремя сдать анализ мочи. Проникновению возбудителя в кровоток нередко способствует хирургическое вмешательство.